I decennier har ex-agenten Raymond “Red” Reddington (James Spader) varit en av FBI mest efterspanade brottslingar. Under första säsongen överlämnade han sig mystiskt åt FBI för att tillsammans med dem jaga personer på sin “Blacklist”, en lista som inkluderar allt från korrupta politiker och maffi aledare till spioner och terrorister. Red är villig att hjälpa FBI mot att Elizabeth “Liz” Keen (Megan Boone) fortsätter som hans partner. Vare sig hon vill eller inte.