Sune, Sophie och Herman åker på scoutläger över helgen. Efter avresan förutspår meteorologerna ett fruktansvärt oväder, och scoutledaren bestämmer sig att det är säkrast att slå läger i en närliggande skolas gymnastiksal. Pappa Rudolf ger sig ut i skogen för att leta! Den försvunne pojkscouten är baserad på TV-serien Sune och hans värld från 2002.