Under Kuwaitkriget kidnappas en grupp amerikanska soldater och hjärntvättas i hemlighet av en korporation, Manchurian Global. De hjärntvättas till att tro att en av soldaterna, Raymond Shaw (Liev Schreiber), räddade dem alla och han blir därför krigshjälte vid hemkomsten. Detta är dock en del i Manchurian Globals konspiration för att ta makten i USA med en av dem kontrollerad president. Shaws befäl, Ben Marco (Denzel Washington), försöker under tiden ta reda på vad som verkligen hände dem under kriget.
