Miljardären och datageniet Harold Finch (Michael Emerson) har byggt en superdator som på förhand kan identifiera terrorhandlingar och våldsdåd. Finch och förre CIA-agenten John Reese (Jim Caviezel) använder okonventionella metoder och teknologi för att förhindra brotten, medan två kriminalare vid New York-polisen (Taraji P. Henson och Kevin Chapman) också blir indragna i fallen och mysterierna.
